Ar-Ge Personelinde Puantaj ve Bordro Mutabakatı: 2026’da Ayrı İzlenmesi Gereken Üç Oran

Ar-Ge / Tasarım / Bordro / ED@ARGE

Ar-Ge Personelinde Puantaj ve Bordro Mutabakatı: 2026’da Ayrı İzlenmesi Gereken Üç Oran

E-DENET Mali Müşavirlik | Mevzuat değerlendirme tarihi: 2 Ekim 2026

Projedeki çalışma oranı, bölge veya merkez dışında çalışmaya ilişkin oran ve gelir vergisi teşviki oranı farklı kavramlardır. Bordro kontrolü bu üç oranı birbirine karıştırmadan kurulmalıdır.

Bir personelin Ar-Ge projesinde görevli olması, bordrosundaki bütün ücretlerin aynı teşvik sonucunu doğurduğunu göstermez. Personelin ay içinde hangi işte çalıştığı, çalışma yerinin ilgili düzenlemelere uygunluğu, ücret kalemlerinin niteliği ve uygulanan teşvik rejimi birlikte değerlendirilmelidir. Puantaj ile bordro arasındaki kontrol bu nedenle yalnızca gün sayılarının eşleştirilmesinden ibaret değildir.

Bu yazı, Teknopark işletmeleri ile Ar-Ge ve tasarım merkezlerinde aylık kontrol düzeni kurulmasına yöneliktir. 4691 ve 5746 sayılı kanunlara dayanan uygulamalar birbirinin aynısı değildir. Merkez dışındaki destekli projeler gibi farklı modellerde de özel şartlar ayrıca incelenmelidir.

1. Önce üç farklı oranı birbirinden ayırın

Kavram Neyi ifade eder? Karıştırılmaması gereken konu
Uygun çalışma süresi payı Fiili çalışmanın ne kadarının uygun proje/görevle ilişkilendirildiği Tek başına vergi teşviki oranı değildir.
Bölge/merkez dışı çalışma oranı İlgili kurala göre dışarıda çalışmanın teşvik kapsamında değerlendirilebilecek sınırı Her ücretin bu oranda vergiden düşülmesi anlamına gelmez.
Gelir vergisi stopajı teşviki oranı Şartları taşıyan ücretlere ilişkin verginin ne ölçüde terkin edileceği Personelin evden çalıştığı saat yüzdesi değildir.

Örneğin 5746 kapsamında öğrenim ve diğer şartlara göre uygulanan ?, ? veya ? gelir vergisi stopajı teşviki oranları, uzaktan çalışma oranı değildir. 4691 kapsamındaki gelir vergisi stopajı teşviki ise kendi kanun ve tebliğ hükümlerine göre hesaplanır; 5746’daki öğrenim oranları Teknopark bordrosuna otomatik aktarılmaz. [2, 3, 5]

2. 2026’da uzaktan çalışma kontrolü nasıl ele alınmalı?

10766 sayılı Cumhurbaşkanı Kararı, 1 Ocak 2026’dan itibaren uygulanmak üzere, 31 Aralık 2026’ya kadar ilgili bölge ve merkezlerde gelir vergisi stopajı teşvikine konu toplam personel sayısı veya teşvike konu toplam çalışma süreleri bakımından bölge/merkez dışında geçirilebilecek sürelerin oranını, niteliği Bakanlıkça belirlenen bilişim personeli için 0, diğer personel için u olarak belirlemiştir. [1]

Buradaki 0 ve u, ücret üzerinden doğrudan uygulanacak gelir vergisi indirim oranları değildir. Ayrıca düzenleme, çalışanın unvanında “yazılım” kelimesi bulunmasını tek başına yeterli hale getirmez. Bilişim personeli niteliği, fiili görev ve ilgili Bakanlık düzenlemeleriyle birlikte değerlendirilmelidir. Bölge/merkez dışındaki çalışmanın proje ve görev bağlantısı da korunmalıdır.

İç kontrol açısından uzaktan çalışma onayı, çalışma kaydı ve üretilen işin kanıtı birlikte izlenmelidir. Proje gereği dışarıda yürütülen faaliyetler ile genel bölge/merkez dışı çalışma imkanları farklı dayanaklara dayanabiliyorsa, aynı sürenin iki ayrı gerekçeyle mükerrer sayılmaması gerekir. Toplam personel veya toplam süreye dayanan uygulama da yalnızca tek çalışanın bordrosuna bakılarak sonuçlandırılmamalıdır.

3. Ücret sınırı: 40 kat kuralını SGK tavanıyla karıştırmayın

7555 sayılı Kanun sonrasında, 1 Ağustos 2025 tarihinden itibaren ilgili ücretlerde gelir vergisi stopajı teşviki ve damga vergisi istisnası için aylık brüt asgari ücretin 40 katına bağlı sınır getirilmiştir. Teknopark uygulamasında 331 Seri No.lu Gelir Vergisi Genel Tebliği; 5746 uygulamasında ise ilgili genel tebliğ değişiklikleri dikkate alınmalıdır. [2, 3, 6]

Çalışma ve Sosyal Güvenlik Bakanlığının 2026 için açıkladığı aylık brüt asgari ücret 33.030 TL’dir. Buna göre 40 kat tutarı 1.321.200 TL olarak hesaplanır. Bu tutar, doğrudan alınabilecek teşvik miktarı değil; ilgili ücret uygulamasındaki üst sınırın brüt ücret karşılığıdır. İlgili ayın ücret kalemleri, çalışmaya isabet eden kısım ve vergi hesabı ayrıca incelenir. [4]

2026 hesap kontrolü: 33.030 TL × 40 = 1.321.200 TL. Bu tutar net ücret sınırı, SGK prime esas kazanç tavanı veya doğrudan vergi iadesi tutarı değildir.

Gelir vergisi hesaplamasında, asgari ücret istisnası ile Ar-Ge/Teknopark stopajı teşvikinin ilgili tebliğlerdeki sırası da korunmalıdır. Aynı vergi tutarı iki kez avantaj hesabına dahil edilmemelidir. Gelir vergisi, damga vergisi ve SGK işveren desteği tek bir yüzde veya tek bir tavan kullanılarak topluca hesaplanmamalı; her biri kendi koşullarıyla kontrol edilmelidir. [2, 3]

4. Puantaj, turnike kaydından daha fazlasıdır

Giriş-çıkış kaydı çalışanın bir yerde bulunduğunu gösterebilir; fakat hangi proje veya görev üzerinde çalıştığını tek başına açıklamaz. Benzer şekilde uzaktan bağlantı kaydı, çalışma süresinin tamamının teşvike uygun faaliyete ayrıldığını göstermeyebilir. Bu nedenle önerimiz, personel–proje–görev–süre eşleştirmesini iş çıktısıyla destekleyen bir aylık kayıt oluşturmaktır.

Varsayımsal örnek: Bir personel için ayın seçilmiş çalışma kayıtları 160 saat olsun. Bu sürenin 80 saati bölge/merkez içinde uygun projede, 40 saati gerekli şart ve onayları sağlanmış uzaktan proje çalışmasında, 40 saati ise teşvik kapsamı dışındaki satış ve idari görevlerde geçsin.

Kayıt türü Saat Kontrol yaklaşımı
Uygun projede yerinde çalışma 80 Proje görevi ve iş çıktısıyla eşleştir.
Şartları sağlanan uzaktan proje çalışması 40 İzin, nitelik ve işletme düzeyi sınır kontrolüyle eşleştir.
Kapsam dışı satış/idari çalışma 40 Uygun proje sürelerinden ayrı izle.
Toplam 160 Puantaj toplamını çalışma kayıtlarıyla mutabık kıl.

Bu örnekte 120/160 = u, yalnızca belirtilen fiili çalışma kayıtları içindeki uygun proje süresi payını gösterir. Ne 10766 sayılı Kararın bütün işletme bakımından sağlandığını tek başına kanıtlar ne de gelir vergisinin doğrudan u’inin terkin edileceği anlamına gelir. 160 saat de mevzuatın her ay için belirlediği evrensel bir bordro böleni değildir. Örnek, izin ve tatil ücretlerinin hesabını göstermek için kurulmamıştır.

5. Ay kapanışında dört dosyayı birlikte kontrol edin

Personel dosyasında teşvik rejimi, görev tanımı, işe giriş/çıkış tarihleri, eğitim belgeleri ve destek personeli sınıflandırması güncel olmalıdır. Destek personeli sınırları ve tam zaman eşdeğer hesapları ilgili rejime göre ele alınmalı; her işletmeye tek bir oran uygulanmamalıdır. [3, 5]

Proje ve süre dosyasında aktif proje dönemleri, personelin görevleri, yerinde çalışma, bölge/merkez dışı çalışma ve kapsam dışı işlere ayrılan süreler birbiriyle tutarlı olmalıdır. Proje sorumlusu ile insan kaynaklarının farklı süreler bildirdiği satırlar, fark açıklanmadan bordroya taşınmamalıdır.

Bordro dosyasında brüt ücret ve diğer ödeme kalemleri, ilgili vergi matrahı, kümülatif matrah, asgari ücret istisnası, 40 kat sınırı ve uygulanacak terkin oranı kontrol edilmelidir. İzin, hafta tatili, genel tatil, ek çalışma ve benzeri kalemler tek bir “Ar-Ge günü” alanına sıkıştırılmamalı; tabi olunan düzenlemenin koşullarıyla ayrı değerlendirilmelidir. [2, 3, 5]

Son olarak bildirim ve muhasebe dosyasında bordro toplamları ile muhtasar ve prim hizmet beyannamesindeki ilgili bilgiler, muhasebe kayıtları ve gerekli bölge/merkez bildirimleri karşılaştırılmalıdır. Sonradan yapılan puantaj değişikliklerinin sadece bir dosyada kalmaması için, değişikliğin hangi hesap ve bildirimi etkilediğini gösteren bir revizyon kaydı tutulmasını öneriyoruz.

E-DENET değerlendirmesi

Bordro kontrolünün doğru başlangıcı “bu personelin teşvik kodu var mı?” sorusu değildir. “Bu ay hangi uygun işte, hangi süreyle çalıştı; bu çalışmanın ücreti hangi rejim ve sınırlarla hesaplandı?” sorusudur. Proje yöneticisi, insan kaynakları ve muhasebenin aynı veri üzerinden kapanış yapması bu soruya cevap vermeyi kolaylaştırır.

2026 uygulamasında uzaktan çalışma düzenlemesi, 40 kat ücret sınırı ve vergi teşviki oranı ayrı kontrol başlıkları olarak tutulmalıdır. Böylece yazılımın ürettiği bordro sonucu yalnızca toplam tutar üzerinden değil, dayandığı veri ve hukuki koşullar üzerinden de doğrulanabilir.

Kaynaklar ve mevzuat dayanakları

  1. 10766 sayılı Cumhurbaşkanı Kararı; 25.12.2025 tarihli, 33118 sayılı Resmî Gazete. 01.01.2026–31.12.2026 dönemi bölge/merkez dışı çalışma oranları. Resmî kaynağı aç
  2. 331 Seri No.lu Gelir Vergisi Genel Tebliği; 04.09.2025 tarihli, 33007 sayılı Resmî Gazete. Teknopark ücretlerinde 01.08.2025 sonrası uygulama. Resmî kaynağı aç
  3. 5746 sayılı Kanun Genel Tebliği (Seri No: 4) ve değişiklik yapan 10 Seri No.lu Tebliğ; 04.09.2025 tarihli düzenleme. Resmî kaynağı aç
  4. Çalışma ve Sosyal Güvenlik Bakanlığı, Asgari Ücretin Net Hesabı ve İşverene Maliyeti; 01.01.2026–31.12.2026 dönemi. Resmî kaynağı aç
  5. 4691 sayılı Teknoloji Geliştirme Bölgeleri Kanunu, geçici 2’nci madde; GİB mevzuat sayfası. Resmî kaynağı aç
  6. 5746 sayılı Kanun Genel Tebliği (Seri No: 5)’nde değişiklik yapan 11 Seri No.lu Tebliğ; GİB açıklayıcı bilgi notu, 04.09.2025. Resmî kaynağı aç

Bu yazı genel bilgilendirme amacıyla hazırlanmıştır. Örnekler varsayımsaldır. Somut işlemlerde ilgili dönemin mevzuatı, sözleşmeler ve belgeler birlikte değerlendirilmelidir.

Muhasebe Ücreti Öde
E-Mükellef Girişi